溶液噴灑與氣態熏蒸

游離的氣態二氧化氯具有很強的氧化作用，能使微生物蛋白質中的氨基酸氧化分解。二氧化氯對細胞壁有更好的吸附和強穿透性，可有效地氧化細胞內含少量的酶；因此，二氧化氯除對一般細菌有殺滅作用外，對細菌，芽孢，病毒，藻類，鐵細菌，硫酸鹽還原菌和粉末等足以很好的殺害殺滅殘留物為水，氯化鈉和微量的二氧化碳，有機糖等無毒物質。

二氧化氯能很好地殺滅細菌，病毒，是由於二氧化氯具有強氧化性，而不會對動，植物機體產生損傷，原因在於細菌，病毒細胞結構與動，植物機體截然不同。

細菌、病毒屬於原核細胞生物，其絕大多數酶系統分佈於細胞膜近表面，易受攻擊；而動、植物多屬真核細胞生物，其酶系統多深入到細胞裡的細胞器中而得到保護，因此它不易與二氧化氯接觸而受到氧化。

二氧化氯氣體由於以分子形式存在，其分子形態比吸附了水的二氧化氯溶液分子更小，因此二氧化氯氣體比二氧化氯溶液對微生物細胞具有更強的透過性，其有效消毒劑量降低。